Emilie Villar

bioinformaticienne & data analyst

En télétravail depuis Marseille

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Proposer un projet La mission ne démarrera que si vous acceptez le devis de Emilie.
Proposer un projet La mission ne démarrera que si vous acceptez le devis de Emilie.

Localisation et déplacement

Localisation
Marseille, France
Télétravail
Effectue ses missions majoritairement à distance

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Secteur d'activité
  • Agroalimentaire
  • Associatif et syndical
  • Biotechnologies
  • Centres de recherche
  • Environnement
+2 autres

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Compétences (17)

Emilie en quelques mots

Avec une formation initiale et une thèse en agronomie, complétée d’une expérience de 7 ans en biologie marine, je vous propose de réaliser l’analyse de vos données biologiques et/ou génomiques sur l’un de ces 2 domaines. Je peux aussi vous accompagner pour la gestion de votre projet scientifique, depuis l’organisation de la partie expérimentale (au laboratoire, en expédition) jusqu’à la coordination des travaux avec vos partenaires.

Bioinformatique:

Assemblage de novo
Mapping
Annotation fonctionnelle et structurale
Comparaison de génomes
Analyse transcriptomique et expression différentielle
Analyse de métagénome
Analyses phylogénétiques
Analyse de données de métagénétique/metabarcoding​

Biostatistiques:

Bio-curation (filtrage de données biologiques)
Récupération de données complémentaires disponibles sur des bases de données scientifiques
Elaboration de bases de données privées
Analyse statistique de données biologiques

Quelque soit votre projet, qu'il soit bien délimité ou encore un peu flou, rencontrons nous pour que vous puissiez m'expliquer quelles sont les questions que vous souhaitez poser à votre jeu de données. Je vous formulerai alors un cahier des charges avec un planning prévisionnel et un devis détaillé.

​A l'issu du contrat, en plus du résultat des analyses et éventuellement de figures, je vous fournirai un compte-rendu écrit (en anglais ou en français) avec un paragraphe Matériel & Méthode à associer à votre future publication.

Partout en France, je me déplace à votre rencontre pour le démarrage du projet et je peux également venir en personne pour le compte-rendu de fin de projet. Entre temps, nous aurons des échanges réguliers sur les avancées de votre projet.

Portfolio

Portfolio uniquement accessible aux membres

Expériences

CNRS - CNRS

Centres de recherche

Data analyst - Bioinformaticienne

Roscoff, France

juin 2016 - juin 2018

Dans le cadre du projet ANR IMPEKAB, j'ai coordonné la mise en place d'une essai au laboratoire sur des collodaires, un groupe de zooplancton symbiotique et colonial. Il s'agissait de tester leur réponse au stress thermique en étudiant à la fois leur physiologie et l'expression de gènes.

CNRS - CNRS

Centres de recherche

Data analyst - Bioinformaticienne

Marseille, France

juin 2012 - mai 2016

Scientifique associée à l'expédition Tara Oceans, ma spécificité était d'intégrer les différents types de données récoltées (métagenomique, imagerie, physico-chimique) pour répondre à des questions écologiques. J'ai travaillé sur 4 grands projets: 1. Les turbulences du courant des Aiguilles 2. La fertilisation autour des îles Marquises 3. Les virus géants marins (projet européen MicroB3) 4. Un site web regroupant les données de Tara Océans (Ocean Gene Atlas).

Recommandations externes

Formations

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