Rechercher un freelance Déposer un projet

Bienvenue sur le profil Malt de Hugo !

Malt vous permet d'accéder aux meilleurs consultants freelances pour vos projets. Contactez Hugo pour échanger sur votre besoin ou recherchez d'autres profils sur Malt.

Hugo Bottois

health data analyst/scientist, dev python

Peut se déplacer à Paris

  • 48.8566
  • 2.3517
Proposer un projet La mission ne démarrera que si vous acceptez le devis de Hugo.
Proposer un projet La mission ne démarrera que si vous acceptez le devis de Hugo.

Localisation et déplacement

Localisation
Paris, France
Peut travailler dans vos locaux à
  • Paris 4e Arrondissement et 50km autour

Préférences

Durée de mission
  • ≤ 1 semaine
  • ≤ 1 mois
  • entre 1 et 3 mois
Secteur d'activité
Préfèrerait :
  • Biotechnologies
  • High tech
  • Santé & bien-être
  • Secteur médical
  • Secteur public & collectivités
Préfèrerait éviter:
Banque & assurances
Taille d'entreprise
  • 1 personne
  • 2 - 10 personnes
  • 11 - 49 personnes
  • 50 - 249 personnes

Vérifications

Charte du freelance Malt signée
Consulter la charte

E-mail vérifié

Influence

Github

Github : hbiom hbiom
  • 1 Followers
  • 11 Repos
  • 5 Gists

Langues

Catégories

Compétences (24)

  • Débutant Intermédiaire Confirmé
  • Langages
  • Débutant Intermédiaire Confirmé
  • Débutant Intermédiaire Confirmé
  • Débutant Intermédiaire Confirmé

Hugo en quelques mots

Bonjour,

je suis docteur en biologie/biothérapie passionné par l'intersection entre la santé, la data et le développement web.

Je vous accompagne dans la gestion de vos projets scientifiques et techniques.

Durant ma thèse, j'ai analysé et visualisé des données biologiques (Transcriptomiques, immunologiques) et cliniques dont les résultats sont publiés dans différents articles scientifiques.

J'ai également développé des algorithmes de machine learning appliquées à l'imagerie médicale et des applications web pour rendre ces solutions accessible aux utilisateurs finaux.

Je peux vous accompagner dans vos projets Web en back-end (Python, Django, Flask) dont le développement d’API pour déployer vos solutions de machine learning, et en front-end pour fournir une interface utilisateur (HTML/CSS, JS).

Plus globalement, je peux utiliser ma double compétence pour vous aider à définir vos besoins et faire le lien entre les biologistes/cliniciens et l'équipe technique

Portfolio

Portfolio uniquement accessible aux membres

Expériences

Hybrid Intelligence - Sanofi

Agence & SSII

Full-stack Developer

Paris, France

novembre 2021 - avril 2022 (5 mois)

Development of MVP (Minimal viable product) to help clinicians to find eligible patients for clinical trials based on inclusion/exclusion criteria and machine learning for a big pharmaceutical group.

Tasks:

- Development of a Django Web application to deploy our NLP solution with API Rest (Databrick)
- Unit testing (pytest)
- Follow-up and tracking of user stories (agile methodology, Jira)

Capgemini Engineering

Biotechnologies

Data Project Leader - Healthcare R&I department

Velizy

septembre 2019 - novembre 2021 (2 ans et 2 mois)

Développement d’aide au diagnostic en couplant le machine learning et l’imagerie médicale

Projets :

- Classification de la malignité des tumeurs du tissus mous basée sur l’imagerie médicale et la radiomique

- Segmentation automatique des ostéosarcomes

- Développement d’API

Tâches :

Elaboration des modèles de machine learning (sklearn, keras, tensorflow)

Test et validation de la performance des modèles (métriques, cross-validation)

Développement d’API et d’application Web pour utiliser nos solutions de machine learning (Django, Flask)

Rédaction et communication des résultats (poster, articles, présentation orale)

Mentoring des stagiaires et d’une équipe incluant des développeurs et des data scientist

Collaboration avec nos partenaires académique spécialisés en analyses d’images médicales (CREATIS, centre Léon Bérard)


Stack technique : Python, Numpy, Keras, Tensorflow, Sklearn, Nibabel, Django, Flask

INSERM UMRS 1160 « Ecotaxie, Microenvironnement et Développement Lymphocytaire» Team 3IC Intestinal Immunity in Inflammation and Cancer

Biotechnologies

Scientific project manager-PhD position

Région de Paris, France

septembre 2015 - avril 2019 (3 ans et 7 mois)

Projet de thèse :

Acquisition et régulation des fonctions effectrices T dans les maladies inflammatoires de l'intestin.

Projets :

Etude transcriptomique et phénotypique des cellules T résidentes de la muqueuse intestinal dans la maladie de Crohn

Etablissement d’un système de coculture autologue avec cellule T de la muqueuse et organoïde de l’intestin pour étudier l’interaction lympho-épithéliale

Etude du récepteur NKG2D dans la maladie de Crohn

Tâches :

Analyse et visualisation des données (cliniques, biologiques)

Analyse des données transcriptomiques (niveau d’expression) de population lymphocytaire

Suivi scientifique et méthodologique, design des études et des protocoles

Communication orale dans le cadre de conférence et collaboration internationale

Écriture scientifique (poster, articles scientifiques, grant)

Mentoring des stagiaires, coordination avec les collaborateurs et les plateformes technologiques

Stack technique : R, Transcriptomique, Bioconductor, cytométrie en flux, culture cellulaire

1 recommandation externe

Consultez les recommandations qu'a reçues Hugo

Formations